Koulutusta voidaan järjestää joko jonkin kaupungin sisällä tai yhteistyössä jollakin alueella eri koulutuksenjärjestäjien yhteistyönä.
Koulutuksen kouluttajana voi toimia RyMy-koulutuksen käynyt opettaja tai muu pedagoginen ammattilainen. Yhtä koulutusryhmää ohjaa työparina kaksi kouluttajaa.
Kouluttajille suositellaan yhdeksän tunnin mittaisen kouluttajakoulutuksen käymistä. Kouluttajakoulutuksessa syvennytään koulutuksen teemoihin ja työtapoihin, tutustutaan kouluttajan vastuisiin ja rooliin sekä koulutuksen käytännön järjestelyihin. Koulutus toteutetaan kahdessa osassa ja se sisältää koulutuskertojen välissä tehtävän välitehtävän.
RyMy-koulutusryhmän ihanteellinen koko on noin 16–20 koulutettavaa, jotta jokaisen aktiivinen osallistuminen on mahdollista. Koulutuksen suorittaminen vaatii jokaiselle koulutuskerralle osallistumista. Koulutuksen prosessimuotoisuuden vuoksi ensimmäiselle koulutuskerralle osallistuminen on välttämätöntä, eikä koulutukseen voi tulla mukaan kesken prosessin.
Tavoitteena on, että mahdollisimman moni koulun ammattilainen (erityisesti opettajat) käyvät läpi koulutuksen koulun koosta riippuen yhden tai kahden lukuvuoden aikana. Tämä vaatii kouluilta erityisjärjestelyitä ja esimerkiksi sijaistarpeiden miettimistä.
Koulutus on suunniteltu vaiheittain eteneväksi kokonaisuudeksi, jossa jokainen koulutuspäivä rakentuu edellisen päälle. Teemat syvenevät ja taidot karttuvat järjestelmällisesti koulutuspolun edetessä. Tästä syystä koulutuspäivien järjestystä ei voi muuttaa. Koulutuskerrat järjestetään yleisimmin kerran kuukaudessa, jotta jää aikaa työssäoppimiselle ja uusien keinojen koittamiselle.
Vaikka päivien järjestys on kiinteä ja perustuu käsikirjassa oleviin harjoitteisiin ja tehtäviin, tärkeintä ei ole se, että käsikirjaa noudatetaan orjallisesti, vaan se, että koulutuspäivän keskeiset tavoitteet ja sisällöt tulevat käsitellyiksi ja osallistujat saavat tarvitsemansa tuen.
Ennen kouluttamisen aloittamista tulee kouluttajien varata riittävästi aikaa koulutuskerran materiaaleihin tutustumiseen sekä koulutuspäivän työskentelyjen valmisteluun yhdessä kouluttajaparin kanssa. Koulutuskerran valmisteluun tulee varata kouluttajalle aikaa vähintään kaksi tuntia jokaista koulutuskertaa kohden.
Toimintatapojen muuttaminen kouluyhteisössä vaatii pitkäjänteistä, johdonmukaista työtä. Rehtori on avainasemassa johtamassa koulunsa pedagogista toimintaa ja käyttäytymisen tukemisen tapoja osana koko toimintakulttuuria.
RyMy-koulutuksen teemoja voidaan koulun arjessa ylläpitää esimerkiksi kuukausittain tai jaksoittain vaihtuvilla teemoilla. Teemat voivat olla esillä esimerkiksi julisteissa tai infotauluilla, ja niitä voidaan oppilaiden kanssa käsitellä esimerkiksi osana luokanohjaajan tunteja tai teemapäivissä. Teemoihin voidaan liittää myös esimerkiksi luokkakohtaista onnistumisten keräämistä koulutuskerralla viisi esiteltyjen motivointiohjelmien mallin mukaisesti.